机关党委共设置13个党支部：

中共梧州学院两办现教中心支部委员会

中共梧州学院组织宣传支部委员会

中共梧州学院统社图教联合支部委员会

中共梧州学院纪委办公室支部委员会

中共梧州学院党委教师工作部（人事处）支部委员会

中共梧州学院学工团委支部委员会

中共梧州学院发展规划处（研究生处）支部委员会

中共梧州学院教务双创支部委员会

中共梧州学院科研处（社科处）支部委员会

中共梧州学院国际交流与国际教育支部委员会

中共梧州学院财务保卫支部委员会

中共梧州学院公管实验审计支部委员会

中共梧州学院后勤服务中心支部委员会